سوالات متداول توالی یابی کل ترانسکریپتوم
1- RNA-seq چیست؟
توالی یابی ترانسکریپتوم یا RNA-Seq روشی بسیار قدرتمند برای مطالعه کمی و کیفی ترانسکریپتوم می باشد. این روش پروفایل کاملی از ترانسکریپتها، ساختار ژنها و سطوح بیان ژنها در دسترس محقق قرار میدهد.
2- مزایای استفاده از RNA-seq چیست؟
- دقت بسیار بالا، با این روش تمام ترانسکریپتها با دقت در سطح تک نوکلئوتیدتوالی یابی میشوند.
- حساسیت بسیار زیاد: با این روش حتی ترانسکریپتهای نادر با تعداد کپی بسیار کم نیز توالی یابی و شناسایی می شوند.
- بدون محدودیت در سطح گونه
- محدوده وسیع شناسایی از ترانسکریپتهای با تعداد نسخه بسیار زیاد تا ترانسکریپتهای با تعداد نسخه بسیار کم
3- تفاوت روش RNA-Seq با روش میکرواری چیست؟
- در روش میکرو اری تنها میتوان ترانسکریپتهای شناخته شده را بر اساس پروبهای طراحی شده برای آنها مورد بررسی قرار داد اما در روش RNA-Seq تمام ترانسکریپتها اعم از شناخته شده و یا جدید مورد شناسایی و ارزیابی قرا میگیرند.
- در روش RNA-seq بازده شناسایی ژنهای با سطوح بیان متفاوت 93% می باشد که این بازده در میکرو اری 73% است.
- حساسیت روش RNA-seq به شناسایی ژنهای با بیان بسیار کم بسیار بیشتر از روش میکرو اری است ( 89 % در مقایسه با 17%)
- همبستگی و تطابق نتایج در میزا بیان ژنها در روش RNA-seq و qPCR بیش از میکرواری و qPCR است.
4- چگونه درخواست خود را به شرکت توپاز ژن ارائه دهم؟ لطفا فرم مربوط به NGS order form را دانلود و بعد از پر کردن، آن را به آدرس ایمیل NGS@topazgene.com ارسال فرمایید.
🔸مقدمه 🔸روش کار 🔸ملزومات نمونه 🔸سوالات متداول
